La Unidad Especializada en Crimen Organizado, Tráfico Ilícito de Drogas, Armas y Personas, de Homicidio y Lavado de Activos asociado (UCOD), es una de las áreas especializadas de la Fiscalía Nacional. Surge luego de la fusión de la Unidad de Drogas y la de Crimen Organizado y Lavado de Activos asociado, con el objetivo de reunir en una sola entidad los principales fenómenos criminales cuyas acciones suponen la existencia de una organización criminal.

La Unidad Especializada en Delitos Económicos, Medioambientales, Ciberdelitos y Lavado de Activos asociados tiene por objeto asesorar, apoyar y colaborar a los fiscales en dichos delitos o fenómenos delictivos, incluyendo los delitos financieros, contra la salud pública, el patrimonio cultural y urbanístico y, en general, la delincuencia emergente o en que sea fundamental el procesamiento de evidencia digital, de acuerdo con las instrucciones que al efecto dicte el Fiscal Nacional.

La Unidad Anticorrupción, Lavado de Activos y Probidad Interna (UNAC), es una de las áreas especializadas de la Fiscalía Nacional y su objetivo es ser un referente técnico para los fiscales y equipos investigativos en materia de corrupción y lavado de activos, asesorando integralmente a los mismos en la persecución penal de fenómenos delictivos que afectan aspectos patrimoniales de la administración del Estado, Poderes del Estado, Gobiernos Regionales, Municipalidades o la propia Fiscalía de Chile, cometidos por funcionarios públicos y/o particular

La Unidad Especializada en Responsabilidad Penal Adolescente, es una de las instancias de la Fiscalía Nacional cuyo propósito es asesorar a fiscales, abogadas/os asistentes y asesoras/es, en todo lo vinculado a la Justicia Penal Adolescente, desde el marco legal a la perspectiva especializada que requieren los casos en que niños, niñas y adolescentes -desde los 14 a 17 años- participan en delitos, de manera individual o como parte de bandas criminales.

La Unidad Especializada en Delitos Sexuales y de Explotación Sexual (USEX) tiene como función brindar asesoría, apoyo y colaboración a fiscales, abogados y abogadas en investigaciones por delitos de violencia sexual, con especial énfasis en aquellos cometidos contra niñas, niños y adolescentes. Para esto, su trabajo incorpora los enfoques de Derechos Humanos en género, y en infancia y adolescencia.

En particular, su asesoría se concentra en cuatro áreas:

La Unidad Especializada en Derechos Humanos (UDDHH), es una de las áreas de la Fiscalía Nacional encargada de asesorar y apoyar la transversalización del enfoque de derechos humanos en la persecución penal, con especial énfasis en el respeto y garantía de las personas que pertenecen a grupos de especial protección por parte del Estado.